Michał Marcjanik przeszedł wszystkie szczeble klubowej kariery w Gdyni, osiągając także funkcję kapitana pierwszej drużyny. Jest wychowankiem Stowarzyszenia Inicjatywa Arka Gdynia. Jest złotym medalistą mistrzostw Polski Juniorów Starszych w 2012 roku oraz srebrnym z 2013 roku. W pierwszym zespole Arki debiutował 23 lipca 2013 roku w spotkaniu pucharowym Pelikan Łowicz - Arka (1:1). Zdobył z Arką w 2017 roku Puchar Polski oraz Superpuchar. Grę w Arce przedzielił występami we Włoszech (sezon 2018/19 Empoli, Carpi) oraz w Wiśle Płock (sezon 2019/20). Wrócił do Gdyni w przed sezonem 2020/21. Obecnie jest w czołówce zawodników z największą liczbą spotkań w barwach Arki. W listopadzie 2023 roku zagrał mecz nr 250. Były to derby z Lechią, w których zdobył zwycięską bramkę z rzutu karnego.